Với công nghệ xử lý nước thải kraft, nếu như nhà máy sản xuất bột giấy không có hệ thống cô đốt thì rất khó để có thể xử lý để chất lượng nước thải đầu ra đạt tiêu chuẩn xả thải với chi phí vừa phải. Đối với các dự án đầu tư mới, vấn đề này đang dần được các đơn vị thiết kế - thi công xử lý khắc phục dần. Hầu hết các nhà máy sản xuất bột giấy ở VN hiện nay đều đang gặp khó khăn trong việc đáp ứng được quy chuẩn B2 (QCVN 12:2008). Ở thời điểm hiện tại, công ty giấy Bãi Bằng là công ty được đầu tư hệ thống cô đốt, nước thải được xử lý bằng kỹ thuật bùn hoạt tính cổ điển – là một trong rất ít đơn vị đáp ứng được quy chuẩn xả thải theo đúng tiêu chuẩn cho phép.

Công nghệ xử lý nước thải nhà máy giấy bao gồm các giai đoạn sau:

-       Giai đoạn tiền xử lý: Là giai đoạn loại bỏ các chất thải rắn có kích thước lớn, bên cạnh đó, giai đoạn tiền xử lý đóng vai trò giảm nhiệt độ, và trung hòa nước thải. Ở giai đoạn này, song chắn rác, bể điều hòa và tháp giải nhiệt là các bước được sử dụng đầu tiên trong giai đoạn tiền xử lý.

-       Giai đoạn xử lý bậc 1: Là gia đoạn loại bỏ cặn ra khỏi nước thải. trong quy trình này, các phương pháp được áp dụng bao gồm: Lắng, tuyển nổi hay kết hợp keo tụ - tạo bông, tách bông cặn.

-       Giai đoạn xử lý bậc 2: Ở giai đoạn này, sử dụng các quy trình xử lý sinh học để loại bỏ BOD5 của nước thải. Khi nồng độ các chất hữu cơ cao thì kết hợp đồng thời 2 quá trình kị ký và hiếu khí.

-       Giai đoạn xử lý bậc 3: Là giai đoạn được áp dụng để xử lý COD một cách triệt để, sử dụng các bước sau:

+    Keo tụ/tạo bông kết hợp lắng và khử trùng (Quá trình này thực hiện ở bể tiếp xúc)

+    Keo tụ/tuyển nổi – khử trùng

+    Xử lý màu bằng phương pháp ô xy hóa