Thuốc nhuộm huỳnh quang gel protein, khi sử dụng kết hợp với hệ thống chụp ảnh tương thích, là cách tiếp cận vượt trội trong phân tích protein so với thuốc nhuộm Coomassie hay nhuộm bạc. Nhuộm gel huỳnh quang có nhiều ưu điểm như là khoảng tuyến tính rộng hơn, độ nhạy cao hơn và có thể sử dụng để phân tích khối phổ. Bio-Rad có cung cấp 3 loại thuốc nhuộm huỳnh quang để tối ưu cho mỗi loại máy chụp ảnh khác nhau.

- Flamingo™ fluorescent gel stain - Dung dịch 10x chứa chất nhuộm phát huỳnh quang khi bám lên các protein đã được biến tính. Thuốc nhuộm gel dễ sử dụng có thể dùng cho cả ứng dụng điện di 1-D và 2-D và có khả năng phát hiện dưới 0.5 ng protein. Quy trình nhuộm gồm 2 bước đơn giản có thể hoàn tất chỉ trong vòng 5 giờ. Không cần bước tăng độ nhạy và bước giải nhuộm. Gel nhuộm cần được bảo quản tránh sáng ở 2-8°C đến 6 tháng mà không làm giảm đáng kể độ nhạy của phương pháp chụp. Khi sử dụng thuốc nhuộm gel huỳnh quang Flamingo vẫn có thể tiếp tục giải khối phổ protein về sau. Gel được nhuộm với thuốc nhuộm gel huỳnh quang Flamingo cũng có thể phát hiện bằng nhiều hệ thuống chụp ảnh, nhưng đặc biệt được tối ưu cho các máy quét huỳnh quang sử dụng nguồn sáng laser như Molecular Imager® PharosFX™