THÔNG TIN CHUNG

+ Hệ thống hoạt động trên nguyên tắc sử dụng hàng triệu đến hàng tỷ sensor để đo sự thay đổi pH của giếng do các ion H+ được sinh ra mỗi khi enzyme polymerase gắn 1 nucleotid vào trình tự khuôn

+ Hệ thống sử dụng công nghệ giải trình tự trên chip bán dẫn với các hóa chất thông thường cho phép chuyển đổi trực tiếp từ dữ liệ hóa học thành dữ liệu số.

+ Hệ thống sửa dụng các hóa chất giải trình tự đơn giản nhất, không sử dụng dye huỳnh quang nên không cần đến các hệ thống quang học đắt tiền (không đèn laser, không phin lọc, không camera), tiết kiệm chi phí, rút ngắn thời gian giải trình tự

+ Thời gian giải trình tự trên máy ít hơn 3 giờ.

+ Hệ thống Ion PGM có thể sử dụng với 3 loại chip với công suất:

– Ion 314 Chip v2: lên tới 100 Mb

– Ion 316 Chip v2: lên tới 1 Gb

– Ion 318 Chip v2: lên tới 2 Gb

+ Chiều dài đoạn DNA sử dụng để đọc trình tự: 200 base hoặc 400base

+ Số lần đọc:

– Ion 314 Chip v2: 400 – 550 nghìn

– Ion 316 Chip v2: 2 – 3 triệu

– Ion 318 Chip v2: 4 – 5.5 triệu

+ Thời gian giải trình tự:

– Ion 314 Chip v2: 2.3 – 3.7 giờ

– Ion 316 Chip v2: 3.0 – 4.9 giờ

– Ion 318 Chip v2: 4.4 – 7.3 giờ

+ Kỹ thuật giải trình tự: Post-Light™ Ion Semiconductor Sequencing

+ Ứng dụng của hệ thống:

– Giải trình tự DNA, RNA

– Phân tích số bản copy

– Giải trình tự các RNA nhỏ

– Giải trình tự hệ gen vi sinh

– Giải trình tự để phân loại vi khuẩn

– Giải trình tự để phân loại virus

– Giải trình tự metagenome

– Giải trình tự ChIP

– Phân tích methyl hóa

– Giải trình tự xác nhận lại các đột biến điểm (SNP)

– Giải trình tự xác định kiểu gen

+ Khả năng thực hiện multiplex lên tới 384 barcodes hỗ trợ bởi phần mềm Torrent Suite với Ion 318 Chip v2

·